Une équipe gouvernementale de transition composée de vingt ministres, dont quatre femmes, sera sous la houlette du Premier ministre, Ali Mahaman Lamine Zeine. Six ministères stratégiques sont confiés aux militaires et au Conseil national pour la sauvegarde de la patrie (CNSP).
Il s’agit bien évidemment du ministère de la Défense avec à sa tête le général Salifou Mody, vice-président du CNSP ; le ministère de l’Intérieur, de la Sécurité publique et de l’Administration du territoire est confié au général Mohamed Toumba, chef d’état-major adjoint de l’armée de terre ; les portefeuilles de la Jeunesse et des Sports, de la Santé, des Transports, de l’Environnement sont également gérés par des militaires.
Le Premier ministre Mahamane Lamine Zeine sera également ministre de l’Économie et des Finances en raison de sa formation d’économiste.